Direi che non devi allineare proprio nulla i 2 file devono essere uguali tranne le mod e il cks che se apri in 2d ecm calcola in automatico
Lascia stare come identifica ecm ,147 e GT sono praticamente la stessa cosa per le ecu e si vede che quella ha stesso hw e sw di una 147.
Se hai letto un file da 2mb è una c39, le c8 sono solo da 1mb. A seconda di che mpps hai mi fiderei più a scriverla come 159 c39 (di 159 c9 non credo ne esistano nella nomenclatura dei protocolli hanno scordato un 3)